MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_3

Total Repeats: 616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017021	ATC	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327285
2	NC_017021	CAA	3	9	154	162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327285
3	NC_017021	GAA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327285
4	NC_017021	AGC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327285
5	NC_017021	GCAA	2	8	230	237	50 %	0 %	25 %	25 %	383327285
6	NC_017021	AAC	2	6	245	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327285
7	NC_017021	TA	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	383327285
8	NC_017021	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327285
9	NC_017021	TGG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383327285
10	NC_017021	AG	3	6	385	390	50 %	0 %	50 %	0 %	383327285
11	NC_017021	AG	3	6	399	404	50 %	0 %	50 %	0 %	383327285
12	NC_017021	GGA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327286
13	NC_017021	AGA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
14	NC_017021	TA	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	383327286
15	NC_017021	TCA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327286
16	NC_017021	AGT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327286
17	NC_017021	ACA	2	6	556	561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327286
18	NC_017021	AAGC	2	8	652	659	50 %	0 %	25 %	25 %	383327286
19	NC_017021	GAA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
20	NC_017021	AGA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
21	NC_017021	TAG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327286
22	NC_017021	CAA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327286
23	NC_017021	GCA	3	9	791	799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327286
24	NC_017021	AGA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
25	NC_017021	ACAG	2	8	856	863	50 %	0 %	25 %	25 %	383327286
26	NC_017021	AGC	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327286
27	NC_017021	GCC	2	6	939	944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383327286
28	NC_017021	AGC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327286
29	NC_017021	ACT	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327286
30	NC_017021	AG	3	6	1065	1070	50 %	0 %	50 %	0 %	383327286
31	NC_017021	TGA	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327286
32	NC_017021	AGA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
33	NC_017021	CCA	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383327286
34	NC_017021	GAG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327286
35	NC_017021	TTG	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017021	GAT	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017021	AAG	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017021	AGA	3	9	1343	1351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017021	AAG	2	6	1416	1421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017021	A	6	6	1430	1435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017021	GCT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327287
42	NC_017021	TGTT	2	8	1512	1519	0 %	75 %	25 %	0 %	383327287
43	NC_017021	CTG	2	6	1533	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327287
44	NC_017021	TGA	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
45	NC_017021	A	6	6	1575	1580	100 %	0 %	0 %	0 %	383327287
46	NC_017021	AGT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
47	NC_017021	AGT	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
48	NC_017021	CAA	2	6	1625	1630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327287
49	NC_017021	TAG	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
50	NC_017021	GGAG	2	8	1673	1680	25 %	0 %	75 %	0 %	383327287
51	NC_017021	AGT	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
52	NC_017021	TA	3	6	1826	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	383327287
53	NC_017021	CAG	2	6	1890	1895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327287
54	NC_017021	A	6	6	1910	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	383327287
55	NC_017021	GA	3	6	1930	1935	50 %	0 %	50 %	0 %	383327287
56	NC_017021	AAG	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327287
57	NC_017021	TAAC	2	8	2085	2092	50 %	25 %	0 %	25 %	383327287
58	NC_017021	AAT	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327287
59	NC_017021	AG	3	6	2233	2238	50 %	0 %	50 %	0 %	383327287
60	NC_017021	GCA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327287
61	NC_017021	CCAT	2	8	2263	2270	25 %	25 %	0 %	50 %	383327287
62	NC_017021	A	7	7	2481	2487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017021	A	7	7	2584	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017021	ATA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327288
65	NC_017021	ATAG	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	383327288
66	NC_017021	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	383327288
67	NC_017021	TCT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327288
68	NC_017021	CAG	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327288
69	NC_017021	TTCT	2	8	2825	2832	0 %	75 %	0 %	25 %	383327288
70	NC_017021	TGA	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327288
71	NC_017021	ATG	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327288
72	NC_017021	A	6	6	2912	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	383327288
73	NC_017021	A	7	7	2933	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	383327288
74	NC_017021	TGTA	2	8	2960	2967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017021	TAA	2	6	3071	3076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017021	CCA	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383327289
77	NC_017021	TGC	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327289
78	NC_017021	ATA	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327289
79	NC_017021	GA	3	6	3262	3267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017021	CAG	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327290
81	NC_017021	ATG	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327290
82	NC_017021	AAC	2	6	3443	3448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327290
83	NC_017021	TAAT	2	8	3542	3549	50 %	50 %	0 %	0 %	383327290
84	NC_017021	ATG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327290
85	NC_017021	TGC	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327291
86	NC_017021	A	7	7	3639	3645	100 %	0 %	0 %	0 %	383327291
87	NC_017021	A	6	6	3696	3701	100 %	0 %	0 %	0 %	383327291
88	NC_017021	AAG	2	6	3705	3710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327291
89	NC_017021	ATA	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017021	ATC	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017021	A	7	7	3817	3823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017021	TAA	2	6	3855	3860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017021	ATA	2	6	3912	3917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017021	A	6	6	3917	3922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017021	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017021	TAT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327292
97	NC_017021	AGG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327292
98	NC_017021	TACAA	2	10	4084	4093	60 %	20 %	0 %	20 %	383327292
99	NC_017021	TGTGA	2	10	4097	4106	20 %	40 %	40 %	0 %	383327292
100	NC_017021	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	383327292
101	NC_017021	AAGA	2	8	4156	4163	75 %	0 %	25 %	0 %	383327292
102	NC_017021	AGA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017021	TGAT	2	8	4230	4237	25 %	50 %	25 %	0 %	383327293
104	NC_017021	AG	3	6	4247	4252	50 %	0 %	50 %	0 %	383327293
105	NC_017021	ATT	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327293
106	NC_017021	TTG	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327293
107	NC_017021	CTT	3	9	4360	4368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327293
108	NC_017021	AGCTA	2	10	4379	4388	40 %	20 %	20 %	20 %	383327293
109	NC_017021	T	6	6	4435	4440	0 %	100 %	0 %	0 %	383327293
110	NC_017021	TC	4	8	4575	4582	0 %	50 %	0 %	50 %	383327293
111	NC_017021	GAA	2	6	4598	4603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327293
112	NC_017021	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	383327293
113	NC_017021	TCA	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327293
114	NC_017021	TGA	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327293
115	NC_017021	AT	3	6	4842	4847	50 %	50 %	0 %	0 %	383327293
116	NC_017021	ATC	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327293
117	NC_017021	CAA	2	6	4978	4983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327293
118	NC_017021	CTTT	2	8	4986	4993	0 %	75 %	0 %	25 %	383327293
119	NC_017021	CAT	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327293
120	NC_017021	ATT	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327293
121	NC_017021	TGT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327293
122	NC_017021	ATT	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327293
123	NC_017021	TTC	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327293
124	NC_017021	CT	3	6	5233	5238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017021	TAT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017021	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017021	GCT	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017021	TGA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017021	AGA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017021	TAC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017021	ATA	2	6	5616	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017021	TAT	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017021	CTTTA	2	10	5724	5733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017021	TGC	2	6	5737	5742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017021	TGA	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017021	TCT	2	6	5807	5812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017021	TGC	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017021	CTA	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017021	ACC	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017021	TTG	2	6	5936	5941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017021	TGT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017021	TAG	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017021	CTG	2	6	6206	6211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017021	TTC	2	6	6232	6237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017021	TACT	2	8	6283	6290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017021	ATG	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017021	AGCTG	2	10	6373	6382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017021	TG	3	6	6434	6439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017021	AAT	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017021	T	7	7	6522	6528	0 %	100 %	0 %	0 %	383327294
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154	NC_017021	TAT	2	6	6723	6728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327295
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158	NC_017021	GCT	2	6	6907	6912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327295
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163	NC_017021	TTTGT	2	10	7191	7200	0 %	80 %	20 %	0 %	383327296
164	NC_017021	TAA	2	6	7213	7218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327296
165	NC_017021	TCA	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327296
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174	NC_017021	TCT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_017021	TTG	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017021	TAC	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_017021	TGCT	2	8	7720	7727	0 %	50 %	25 %	25 %	383327298
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294	NC_017021	CTA	2	6	11661	11666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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405	NC_017021	AATGTA	2	12	16163	16174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
406	NC_017021	T	6	6	16178	16183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_017021	TC	3	6	16211	16216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
410	NC_017021	AT	3	6	16269	16274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_017021	CAT	2	6	16277	16282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_017021	CTT	2	6	16292	16297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_017021	TCA	3	9	16308	16316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_017021	CAA	2	6	16333	16338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_017021	AAT	2	6	16386	16391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_017021	TAC	2	6	16436	16441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_017021	CTA	2	6	16560	16565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_017021	AGT	2	6	16613	16618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
420	NC_017021	ATT	2	6	16631	16636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_017021	AAT	2	6	16759	16764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_017021	TCA	2	6	16818	16823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_017021	TAC	2	6	16910	16915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_017021	CAT	2	6	17282	17287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_017021	ATC	2	6	17288	17293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_017021	GGT	2	6	18349	18354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017021	TTA	2	6	18355	18360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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